Сад основан в 1638 году как Hortus Medicus — аптекарский огород. Травы были сырьём для лекарств: врачи и аптекари изучали здесь лечебные растения, а аптекари сдавали экзамены. В 1646 году префект Йоханнес Сниппендал впервые описал всю коллекцию — 796 видов. Всё, что растёт сегодня в саду Сниппендала, было в том списке.
Пальмовую оранжерею спроектировал в 1911 году Йохан Мелхиор ван дер Мей по заказу профессора Хуго де Фриса; сейчас это охраняемый памятник. Здесь живут цикады — растения, пережившие появление и вымирание динозавров. Самой старой больше 300 лет, а рядом — Encephalartos woodii, вымерший вид, от которого остался единственный мужской экземпляр.
Климатическую оранжерею в 2025 году целиком перестроили в устойчивую, CO2-нейтральную: в ней три зоны — джунгли, пустыня и южноафриканский ландшафт. В маленькой оранжерее круглый год летают тропические бабочки, а вокруг растут кофе, какао, чай, рис, перец и сахарный тростник.
1638 — год основания сада
796 — видов в первом каталоге 1646 года
300 — с лишним лет самой старой цикаде сада